在双向电泳前用亲和层析、离子交换，疏水层析的方法来分离复杂的蛋白成分。
在双向电泳前选择一种适合的蛋白层析方法可加强低丰度蛋白的回收。
如用blue gel去除白蛋白，用阴阳离子交换去除酸性蛋白或碱性蛋白，使目标样品浓度大大提
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